乌鲁木齐所在的城市区域，起源于清代的五座城池。他们分别是土堡城、迪化城、老满城、新满城、皇城。
    元明时期，新疆卫拉特蒙古的其中一部、准格尔部日渐强大。1639年，巴图尔珲台吉定都并筑城于新疆和布克赛尔，建立了准格尔汗国。并统一了新疆北部地区的卫拉特蒙古各部，统治势力达到天山南北及中亚草原。乌鲁木齐地区当时是一片牧场。一直为准格尔部落生活的游牧地。准格尔蒙古语把这个地方称作：“乌鲁木齐”，意为“优美的牧场”。 因蒙古部落习于游牧，少见城池。
    土堡城——1755年（乾隆二十年）清朝政府平定准格尔叛乱，天山北部准格尔汗国灭亡，时位于乌鲁木齐地方的准格尔部城堡毁于战火，这座城当时位于今九家湾附近。清军进驻乌鲁木齐地方后，就在此地（九家湾）又修筑一座夯土城堡，驻军屯田戍卫。并将此地正式定名乌鲁木齐。　　
    迪化城——清乾隆二十三年（1758年），为了驻军屯田之便，清军在乌鲁木齐河（现河滩快速路原址）东面，红山以南再选址修筑了一座城堡，此城堡周长一里五分，城墙高一丈二尺。就此，乌鲁木齐城的雏形在红山南面形成，此后几年，清政府陆续派遣兵丁前来乌鲁木齐屯垦，又从肃州（今甘肃酒泉）、安西、高台等地先后募民七八百户前来乌鲁木齐屯垦，再加上当时的遣犯人每人给屯地12亩，与兵丁一体计亩纳粮，家属5亩，乌鲁木齐此时已有军民1万多名，市肆500余间。清乾隆二十七年(1762年)，由于屯政需要，迪化周边又建军屯城堡，从头宫、二宫沿途设堡西达头屯堡（今头屯河）。
    1763年（清乾隆28年），随着城堡内街市房屋渐加稠密，乌鲁木齐原筑城堡随之因势扩建，城垣加高至1丈6尺，厚1丈，周长由初垒土堡1里6分扩大到4里5分。乾隆帝钦定扩建后的城名为“迪化”，意为“启迪教化”。
    迪化城设四个城门，南门为“肇阜门”，城外有关厢，名曰南关。位于现在的南门花坛经解放南路至山西巷口，南门一带从建城以来，就是繁华的商业区。
    北门名为“景惠门”， 1934年打通北梁坡，并改景惠门为永安门。人们习称北门。位于解放北路北端，健康路、文艺路、光明路、青年路交汇处一带。东门叫“惠孚门”，位于现在的建国路一带。西门名为“丰庆门”，也叫大西门，在现在的中山路新中剧院西侧，民国时期改名为中山门，昔日的大西门内外，是全市的繁荣地区之一。
    1886年（清光绪十二年）将原来的四道城门辟为七道。城西建了小西门，也称“徕远门”。小西门在小十字以西，人民电影院、徕远路一带。小西门主要为说书场，也有一些设摊卖药的江湖游医和挑担流动的零食小商。
    位于现在解放北路和中山路交汇处的大十字，当时因以城中心两路相交的十字形而得名。这一方圆一平方公里的地方，历经沧桑。早在清乾隆二十八年（1763年）原迪化城建成后，大十字的商店日见增多，初步形成了市内的商业区。1870年，中亚浩罕国阿古柏占领迪化后，大十字受到了严重摧残破坏。1876年刘锦棠率清军收复北疆后，关外行商纷纷在大十字置房设店，形成津、晋、湘、鄂、豫等八帮商务。当时以津帮“永裕德”“同盛合”、“复泉涌”、“聚新永”等字号开设的商店最盛，号称津帮“八大家”。
    小十字位于解放北路和民主路的交汇处，1943年由于开辟“建新门”而形成小十字。解放前的小十字是个比较繁华的商业区。
    当时的迪化绕城一周才不过5里左右，城里居住的多数是清军中汉族官兵及其部分家属，所以那时的迪化城也被称为‘汉城’。出城往六道湾方向有红山嘴，昔日，乌鲁木齐河经常洪水泛滥，肆虐成灾，民间传说红山和雅玛里克山两山若一旦合拢，乌鲁木齐河被阻断，城区便将化为汪洋泽国。为了“镇山锁水”，清乾隆五十三年(1788年)，清都统尚安下令在在红山嘴和雅玛里克山上各建了一座实心青砖“镇龙宝塔”，清嘉庆四年(1799年)红山上曾修建玉皇庙一座,此庙“殿宇巍峨,赤土垩壁”，俗称红庙子。山麓还修建有大佛寺、北斗宫、地藏寺等宗教建筑。红山后山（新民路、北山坡一带）时为乱坟岗，建有纸字炉（烧纸钱用）和百骨塔（慈善机构收敛无人认领尸骨）。今光明路南原是一片乱坟岗，有湖北义园和中州义园，两者中间是处决犯人的刑场。1935年前后，随城市扩建，这里的墓群才陆续迁出。
    古城沧桑——“迪化城”建成以后，随着城市的发展和影响，内地一些灾民开始往迪化周边迁徙，在迪化周边逐渐又形成了多个“新城”，清政府将这些新城分别命名为“宁边”（今昌吉），“辑怀”（今米泉），“宣仁”（今二宫）。“乐全”、“宝昌”（今安宁渠镇四十户乡）、“惠徕”（今六道湾）、“屡丰”（今七道湾）等等。
    1864年，妥明反清攻陷占领迪化城后，于1868年又在迪化城南门外(今团结路六中一带)修筑新城，自称为“皇城”，并自封作“清真王。”
    1870年与沙俄勾结的浩罕军官阿古柏又攻陷占领迪化。此后，迪化城也在阿古柏军与“清真王”的几经易手中饱经战火的摧残破坏。

    早在1825年（清道光五年），乌鲁木齐都统英惠就在迪化城东侧修筑了“满营土城”（即今建国路一带），调满营官兵驻居。因是清军满营官兵及随军家属驻扎的地方，因而得名“满城”。
      即：新满城。1880年，清军平定阿古柏和回乱收复新疆后，乌鲁木齐都统恭镗又在迪化城偏东的高地上重新建满城，围地四里三分，使新满城与迪化城东西毗连。竣工后，调满族官兵及眷属进驻。满城的建筑格局与全国各满城类同，十分讲究。
      
    1884年新疆建省，1886年为适应建省后的需要，首任新疆巡抚刘锦堂曾呈请朝廷拨银六万三干两百多两，改建满城和汉城，于满城东南隅起接至汉城南门止，扩展城基，使满城和汉城两城合而为一，合并扩建，拆除了满城城墙，将新城墙增高增厚，形成一座东西较长，南北较窄的不规则形的城市。迪化城城周扩展至11.52公里，面积约23.2平方千米，人口约2.4万，城门增至七个，原南北街被拓宽后改建成现在的建国路，原东西街是现在的前进路，中街一带是现在的光华路。东偏南辟有新东门，南之左有新南门，西偏北有新西门。至此，新满城不复存在。
    至清光绪十二年（1886年）迪化城周长扩展后，以大小十字为中心的市区有4条大街，市区各类楼房面积173万平方米，最高的为4层，均为砖木结构，土木结构，市区道路大多为砾石或砂石路。"
    迪化城自清末至民国时期，市区仅限于乌鲁木齐河东侧、从南梁到红山的狭长地带，人口也只10万人左右，1949年10月25日，新疆和平解放，1953年新政府根据政务院《关于更改具有歧视少数民族含义的地名的决定》，决定废除“迪化”旧名， 1954年2月1日起，改为“乌鲁木齐”（准噶尔蒙古语）。后来又拆除了城门和城墙，迪化老城逐渐退出了历史舞台。
    老满城（巩宁城）——清乾隆三十七年（1772），清朝政府为了加强迪化的守备，又在迪化城西八公里处另修筑一座城” 并由乾隆皇帝钦定城名为“巩宁城”，取意“巩固安宁”之意。（位于今新疆农业大学），为乌鲁木齐都统衙署及满营驻地，移迪化城内满营官兵3000人驻城中。巩宁城也设四门，东门叫“承曦”，西门叫“宜穑”，南门为“轨同”，北门是“枢正”，并以满、蒙、汉、维吾尔文书于城门顶端，城内建筑繁华，都统衙门碧瓦朱门，城内兵营森严，庙宇辉煌，商旅繁茂，城内分为十字形大街四条，有官署兵营及民房共计9550间。东门有‘文庙’和‘先农坛’，北门有‘关帝庙’，西门有‘社稷坛’。嘉庆年间又增建了 ‘娘娘庙’，‘天星庙’等。城楼、角楼、钟鼓楼与万寿宫、城隍庙、文昌宫等庙宇祠堂相映生辉。因当时城内驻扎的是满族官兵和随军的旗人家眷老小。所以人们称之为“满城”。 1842年秋冬时节，林则徐发配伊犁还曾到过满城。
    巩宁城周长9里多，比迪化城规模大。从满城到迪化（汉城）要经过乌鲁木齐河，河床原有河水两道，为了便于行人来往，1763年，清政府在乌鲁木齐河上架设了一座“长数十丈，宽可行车”的木桥，名为“虹桥”。（即现在的西大桥），1906年，重修后命名为“巩宁桥”，因为在城西边故得名“西大桥”。位于‘巩宁桥’西岸旁有一片杂乱无章的天然林地“树窝子” 此处有一个因乌鲁木齐河摆动而遗留形成的一片湖沼,长满芦苇，俗称“海子”。 被辟为官员休憩之地，1884年,在扩建城市的同时,对“海子”进行了清理,并整修了堤岸,遂改名为“鉴湖”（意为澄清可鉴),继而在湖南岸建造两层小阁楼一座(即今湖心亭)。名为“鉴湖公园”,这就是现在的西公园
    古城劫难——1864年，回族阿訇妥明以宗教作号召，发动回民攻陷巩宁城，破城后将城内的建筑全部烧毁。至此巩宁城十之八九被毁破坏。
    民国时期，新疆省立师范学校在老满城废墟上建校舍，后来又改为国民党陆军38师、骑5师驻军的军营。解放后在原师范学校的基础上建成了现在的新疆农业大学。